Het genetische rapport van uw kind begrijpen
Wanneer u voor het eerst een genetisch rapport over uw kind ontvangt, kan het voelen alsof het in een heel andere taal is geschreven.
Lange woorden. Tekenreeksen van letters en cijfers. Tabellen vol codes die onmogelijk te begrijpen lijken.
Veel ouders vertellen ons hetzelfde:
"We hebben het rapport... maar we begrijpen niet echt wat het betekent."
Als dit bekend klinkt, ben je niet de enige.
Deze gids is hier om u te helpen de belangrijkste onderdelen van een genetisch rapport te begrijpen, zodat u zich wat zelfverzekerder kunt voelen als u het leest — zonder dat u wetenschapper hoeft te worden.
Het doel is niet om elk getal of technisch detail te decoderen. In plaats daarvan willen we u helpen de belangrijkste stukjes informatie te herkennen en te begrijpen welk soort genetische verandering uw kind in de wereld heeft NARS1-gen, en weet waar u verdere ondersteuning kunt vinden.
Een snelle samenvatting: DNA, genen en chromosomen
DNA
DNA is de lange chemische code die alle instructies bevat voor hoe het lichaam groeit en werkt. DNA is een eenvoudig alfabet van slechts vier letters: A, C, T en G.
Genes
DNA is verdeeld in specifieke secties die gGenes worden genoemd. Het zijn als individuele recepten die langs het DNA zijn geschreven. Elk gen vertelt het lichaam hoe je een specifiek eiwit maakt dat een belangrijke taak uitvoert.
The NARS1-gen geeft instructies voor het maken van het NARS1-eiwit, dat cellen helpt andere eiwitten op te bouwen die het lichaam nodig heeft.
Chromosomen
Chromosomen zijn als boeken gemaakt van DNA die veel genen bevatten. Mensen hebben meestal hun hele DNA verdeeld in 46 chromosomen, geregeld in 23 paar. Elke ouder draagt één set chromosomen (23) bij aan de 46 chromosomen van het kind.
De meeste genen komen binnen twee exemplaren
Als een of beide kopieën van een gen een belangrijke verandering bevatten (een zogenaamde a variant), kan het van invloed zijn op hoe dat gen werkt en soms leiden tot een gezondheidstoestand.
Wat een genetisch rapport je echt vertelt
Hoewel genetische rapporten er ingewikkeld uit kunnen zien, beantwoorden ze meestal drie hoofdvragen:
Welk gen erbij betrokken is en waar
Wat voor verandering (variant) werd gevonden
Wat wetenschappers momenteel geloven dat verandering betekent
Normaal gesproken bevat uw rapport een tabel waarin de geïdentificeerde variant of varianten worden beschreven.
Voor veel NARS1-families zijn er twee varianten, één geërfd van elke ouder. In andere gevallen kan een variant verschijnen de novo, wat betekent dat het spontaan optrad tijdens de bevruchting van het kind/rond de eieren.
Waarom sommige rapporten één variant laten zien en andere twee
Er zijn twee belangrijke manieren waarop NARS1-varianten in rapporten kunnen verschijnen.
De novo varianten
Soms verschijnt er een variant nieuw in het DNA van het kind, ook al draagt geen van beide ouders het in hun somatische cellen (niet betrokken bij de voortplanting).
Dit wordt een de novo variant.
In deze gevallen mag het rapport alleen maar aantonen eén variant.
Erfde varianten
Als beide ouders een gewijzigde kopie van het gen bij zich hebben, kan het kind twee varianten erven.
Soms zijn dit
Dezelfde variant in beide kopieën van het gen (geroepen autosomaal recessief of homozygoot)
Twee verschillende varianten (geroepen verbinding heterozygoot)
In deze gevallen zal het rapport meestal worden weergegeven twee rijen of twee tabellen, één voor elke variant.
Het variantgedeelte kan er in verschillende rapporten anders uitzien
Elke laboratoriumformat rapporteert iets anders.
Sommige rapporten tonen de informatie in tabellen. Anderen beschrijven de varianten in paragrafen of opsommingstekens.
Het gedeelte waarin de variant wordt beschreven, kan ook onder verschillende kopjes verschijnen, afhankelijk van het laboratorium of land.
In de meeste rapporten zijn details opgenomen zoals
the gennaam
the variantbeschrijving
the classificatie
the zygotie
the erfenis
soms genomische coördinaten
Je zou titels kunnen zien als
Variant
Variantdetails
Volgordevariant
Moleculaire vondst
Genetische bevindingen
Variantinterpretatie
Gedetecteerde variant
Hoewel de formulering kan variëren, lijkt de verstrekte informatie doorgaans sterk op elkaar.
Als u niet zeker weet waar een sectie naar verwijst, op zoek naar de gennaam (bijvoorbeeld NARS1) en de variantbeschrijving is vaak de makkelijkste manier om jezelf te oriënteren.
Een voorbeeldvariant uit een rapport
Een verslag kan een tabel bevatten die er ongeveer zo uitziet
Op het eerste gezicht ziet dit er ingewikkeld uit, maar elk onderdeel beschrijft eenvoudigweg een ander aspect van de variant.
Laten we het afbreken.
Begrijpen van de HGVS-variantbeschrijving
De variantbeschrijving volgt internationale regels genaamd HGVS-nomenclatuur.
Hoewel het er technisch uitziet, bevat het meestal twee belangrijke onderdelen:
a Verandering op DNA-niveau
a verandering op eiwitniveau
Voorbeeld:
NARS1 c.268C>T p.(Arg90Ter)
De verandering op eiwitniveau
Het deel dat begint met p. beschrijft wat er gebeurt met het eiwit dat het gen normaal produceert.
Eiwitten zijn gemaakt van bouwstenen genaamd aminozuren, die zijn geschreven met behulp van drielettercodes.
Voorbeeld:
p.(Arg90Ter)
Dit betekent:
Arg
arginine, het aminozuur dat zich op deze positie zou bevinden 90
de positie binnen het eiwit Ter
een stopsignaal
Dit zegt ons dus:
"Op positie 90 is arginine veranderd in een stopsignaal."
Dit type verandering wordt a genoemd onzin of stop-gain-variant.
Omdat de instructies vroegtijdig stoppen, kan het eiwit onvolledig zijn en niet goed kunnen functioneren.
Soms wordt het stopsignaal geschreven als
Ter
*
X
Ze bedoelen allemaal hetzelfde.
De verandering op DNA-niveau
Het deel dat begint met c. beschrijft de verandering in de DNA-sequentie van het gen.
Voorbeeld:
c.268C>T
Dit kan worden opgesplitst als
c.
dit vertelt ons dat we naar de coderende DNA-sequentie kijken 268
de positie in het gen waar de verandering optreedt C>T
de DNA-letter C is vervangen door T
Dit betekent dus:
"Op positie 268 in het NARS1-gen is de letter C vervangen door T."
Je zou ook andere uitgangen op DNA-niveau kunnen zien zoals
del
verwijdering (letters verwijderd) ins
invoeging (letters toegevoegd) dup
duplicatie (letters gekopieerd) delins
letters verwijderd en vervangen door verschillende
Bijvoorbeeld:
c.250_253del
Dit betekent dat de letters op posities 250–253 zijn verwijderd.
Andere eiwitveranderingen die u mogelijk ziet
Frameshift-variant
Voorbeeld:
p.Lys84Serfs*12
Dit betekent:
lysine op positie 84 wordt serine
het leesraam van het eiwit verschuift
een stopsignaal verschijnt 12 aminozuren later
Een frameshift is een beetje als het verwijderen van een letter in het midden van een zin, alles na dat punt wordt verkeerd gelezen.
Voor eiwitten resulteert dit meestal in een verkort en niet-functioneel eiwit.
Missense-variant
Voorbeeld:
p.Arg412Gly
Dit betekent dat arginine op positie 412 is vervangen door glycine.
Deletie
Voorbeeld:
p.Lys84del
Dit betekent dat het aminozuur lysine op positie 84 is verwijderd.
Hoe je je variant leest
Nu u over al deze informatie beschikt, hoe gebruikt u deze om uw variant te lezen en te begrijpen?
Dit diagram belicht de belangrijkste onderdelen van een variantbeschrijving, zodat u snel kunt zien wat elk onderdeel betekent.
Voorbeeld:
NARS1 c.268C>T p.(Arg90Ter)
NARS1
het betrokken gen c.268C>T
de verandering op DNA-niveau p.(Arg90Ter)
de verandering op eiwitniveau
De andere elementen in uw rapport begrijpen
Zygositeit: hoeveel exemplaren worden beïnvloed
Het rapport zal ook beschrijven hoeveel kopieën van het gen de variant bevatten.
Veel voorkomende termen zijn onder meer
Heterozygoot
Eén kopie van het gen heeft de variant en de andere niet.
Homozygoot
Beide kopieën van het gen bevatten dezelfde variant.
Verbinding heterozygoot
Elke kopie van het gen bevat een andere variant.
Veel kinderen met NARS1-stoornis zijn samengesteld heterozygoot: twee heterozygote varianten — één in elke kopie van het gen.
Erfenis: waar de varianten vandaan kwamen
Het rapport kan ook aangeven waar de varianten vandaan kwamen. Hiervoor moet het ouderlijke DNA samen met dat van het kind worden gesequenced.
Bijvoorbeeld:
Moederlijk
geërfd van de moeder Vaderlijk
geërfd van de vader De novo
nieuw bij het kind en niet aanwezig bij beide ouders in somatische cellen
Zowel erfelijke als de novo varianten worden gezien in NARS1-families.
Classificatie: wat wetenschappers denken dat de variant betekent
Genetische laboratoria wijzen ook een classificatie, wat hun huidige begrip van de variant weerspiegelt.
Veel voorkomende categorieën zijn onder andere
Pathogeen - Ziekteveroorzakend.
Waarschijnlijk pathogeen - Zeer waarschijnlijk ziekteverwekkend.
Variant van onzekere betekenis (VUS) - Wetenschappers weten nog niet of de variant ziekte veroorzaakt.
Waarschijnlijk goedaardig/goedaardig - Het is onwaarschijnlijk dat dit ziekten veroorzaakt.
Omdat NARS1-stoornis is uiterst zeldzaam en wordt nog steeds onderzocht, onzekere classificaties zijn vrij gebruikelijk.
Dit kan verontrustend aanvoelen, maar het weerspiegelt eenvoudigweg dat de wetenschap nog steeds leert.
Naarmate er meer families worden geïdentificeerd en er meer onderzoek wordt gedaan, kunnen er enkele varianten zijn in de loop van de tijd opnieuw geclassificeerd.
Dit is een van de redenen waarom de Rory Belle Foundation nauw samenwerkt met gezinnen en onderzoekers over de hele wereld. — Het delen van informatie helpt het begrip van NARS1 te verbeteren.
Genomische coördinaten: de GPS-locatie van het genoom
Sommige rapporten bevatten ook iets dat heet genomische coördinaten, die er als volgt uit zou kunnen zien
Chr18 (GRCh38):g.57615715G>A
Dit beschrijft exact dezelfde genetische verandering, maar met behulp van de volledige kaart van het menselijk genoom.
Het opsplitsen:
Chr18
de variant bevindt zich op chromosoom 18 GRCh38
de versie van het menselijke referentiegenoom die door het laboratorium wordt gebruikt. g.57615715G>A
op positie 57.615.715 op dat chromosoom, de DNA-letter G is veranderd in A
Je kunt dit zien als de GPS-coördinaten van de variant binnen het menselijk genoom.
Wetenschappers en laboratoria gebruiken deze informatie om er zeker van te zijn dat ze de exact dezelfde genetische verandering bij het delen van data en onderzoek.
Ouders hoeven deze regel over het algemeen niet in het dagelijks leven te gebruiken, maar het kan wel in rapporten voorkomen, dus het is nuttig om deze te herkennen.
Je hoeft niet alles te begrijpen
Genetische rapporten zijn complex, zelfs voor professionals.
Het is volkomen normaal dat ouders zich overweldigd voelen als ze ze voor het eerst lezen.
Het begrijpen van slechts een paar belangrijke stukjes informatie, zoals de gennaam, de variantbeschrijving, en de classificatie, kan een rapport al veel beter beheersbaar laten aanvoelen.
Als u meer wilt weten over de NARS1-stoornis zelf, kunt u onze gids lezen
We zijn hier om te helpen
Als u niet zeker weet wat de melding van uw kind betekent, houd er dan rekening mee dat u niet de enige bent.
De Rory Belle Foundation is hier om gezinnen in elke fase te ondersteunen, van diagnose tot en met het begrijpen van de wetenschap achter NARS1.
Soms is de eerste stap simpelweg iemand helpen het rapport in duidelijke taal uit te leggen.
Alsjeblieft neem contact op als je ondersteuning nodig hebt
Laatste woord - Hoe het genetische rapport van uw kind onderzoek kan ondersteunen
Als u het genetische rapport van uw kind begint te begrijpen, hoort u mogelijk ook over de rol ervan in onderzoek.
Deelnemen aan onderzoek is altijd een persoonlijke keuze, maar voor gezinnen die er wel bij betrokken willen raken, kan het genetische rapport een belangrijke rol spelen.
Het rapport van uw kind helpt onderzoekers:
Begrijp precies welke variant je kind heeft
Hierdoor kunnen onderzoeksteams studies, tests en potentiële therapieën ontwerpen die zijn afgestemd op specifieke genetische veranderingen, zonder dat families complexe variantdetails hoeven te onthouden.Neem uw kind op in onderzoeksplatforms en natuurhistorische studies
Deze onderzoeken helpen een duidelijker beeld te krijgen van de manier waarop NARS1 kinderen in de loop van de tijd beïnvloedt, wat essentieel is voor het ontwikkelen van toekomstige behandelingen.Overervingspatronen beter begrijpen
Wanneer varianten worden geërfd, kan deze informatie onderzoekers helpen oudermonsters te gebruiken als vergelijkingen in het laboratorium, waardoor de kwaliteit van het onderzoek wordt versterkt.
In de loop van de tijd helpt deze gedeelde kennis het onderzoek vooruit te helpen, waardoor we dichter bij een beter begrip van NARS1 komen en toekomstige behandelingen ontwikkelen.
Als u meer wilt weten over hoe u betrokken kunt raken, kunt u onze - bezoeken Natural History Studies pagina
Er is nooit druk om deel te nemen, maar als u geïnteresseerd bent, kan de Rory Belle Foundation u door de opties leiden.